Ranah penelitian dan kajian akademik sering bersinggungan langsung dengan disiplin ilmu terapan. Pusat Studi di lingkungan Fakultas Ilmu Agama Islam didirikan untuk menunjang berbagai topik riset di dunia industri meliputi bidang Hukum Keluarga Islam, Pendidikan Agama Islam dan Ekonomi Islam.
Pusat Studi Fakultas Ilmu Agama Islam membuka kerjasama dengan mitra peneliti untuk mengeksplorasi masalah dan menghasilkan solusi sebagai penentu arah kebijakan tepat guna. Adanya kolaborasi antara akademisi kampus dan praktisi di bidang industri memungkinkan keduanya mampu menemukan solusi komprehensif dari dua latar belakang yang berbeda.

Berikut ini adalah daftar Pusat Studi yang dimiliki oleh Fakultas Ilmu Agama IslamUII: